Làn da của Jackson có màu nâu vừa phải trong suốt thời niên thiếu, tuy nhiên bắt đầu từ giữa những năm 1980, làn da của ông dần trở nên nhạt hơn, trong đó phần lớn là do những ảnh hưởng từ bạch biến, nhưng cũng bị cho là có sự can thiệp của liệu pháp tẩy trắng da và công nghệ thay đổi đặc tính cơ thể xuất phát từ châu Âu. Theo người viết tiểu sử về Jackson J. Randy Taraborrelli, vào năm 1986, Jackson được chẩn đoán mắc bệnh bạch biến, mà theo Taraborrelli cho rằng nó được xem là hậu quả (theo ý kiến từ bác sĩ) của việc sử dụng hoá chất tẩy trắng trong nhiều năm.[1] Tuy nhiên, việc tẩy trắng làn da không phải là nguyên nhân duy nhất gây ra bạch biến, đó là một căn bệnh không lây nhiễm thuộc dạng rất hiếm. Những nguyên nhân thường được xem xét là do yếu tố di truyền, hệ miễn dịch, và môi trường sống. Từ 1% đến 2% dân số thế giới được xem là bị ảnh hưởng bởi căn bệnh trên. Việc thay đổi sắc tố da hoàn toàn có thể xảy ra và ảnh hưởng đến tất cả dân tộc/sắc tộc một cách bình đẳng.[6]

Taraborrelli cho rằng Jackson đã thể hiện mong muốn làm cho mũi của mình trở nên thanh thoát hơn vào cùng thời điểm xảy ra những biến đổi trên làn da của ông, và khi đó ông đang sử dụng loại kem tẩy trắng da không cần kê toa gọi là Porcelana để giúp làn da của mình trở nên sáng hơn. Jackson nói rằng chị gái của ông, La Toya cũng sử dụng loại kem nói trên, và họ đã tích trữ loại kem này tại nhà của họ ở Hayvenhurst, như là "sản phẩm làm đẹp có giá trị nhất từng được sản xuất."[7] Những thay đổi bắt đầu xuất hiện rõ rệt của Jackson cũng là lúc ông vấp phải sự soi mói của giới truyền thông,[8] cũng như tranh cãi từ công chúng. Những nhà tâm lý học người Mỹ gốc Phi lập luận rằng Jackson là "một tấm gương tệ hại cho thanh thiếu niên da đen". Bác sĩ Dennis Chestnut cho rằng Jackson đã "khiến các thanh niên da đen có một cảm giác rằng họ cũng có thể làm được (như ông)". Mặt khác, nhiều người cho rằng hành động của Jackson được cho là để thúc đẩy sự nghiệp của ông. Tiến sĩ Halford Fairchild nói rằng Jackson và một số người nổi tiếng người Mỹ gốc Phi khác đang cố gắng "để trông giống như người da trắng để có được nhiều vai diễn hơn trong các bộ phim và trên truyền hình".[9]

Bác sĩ phẫu thuật Pamela Lipkin, hành nghề tại New York, người đã không bao giờ được điều trị Jackson hay xem xét các hồ sơ y tế của ông, cho rằng "có lẽ Jackson đang thể hiện mong muốn sở hữu những thuộc tính như người da trắng: Da anh ngày càng trắng hơn. Mũi của ông mỗi lúc một thon gọn sau mỗi 6 tháng. Môi ông ngay càng mỏng hơn, lông mày của ông dần cao hơn.... Đôi mắt và gò má của ông cũng như vậy."[10]

Tuy nhiên, trong một lần trả lời phỏng vấn với Oprah Winfrey vào tháng 2 năm 1993, Jackson bác bỏ những tin đồn về việc anh tẩy trắng da và thừa nhận mình mắc bệnh bạch biến.[11] Khoảng 62 triệu người Mỹ đã theo dõi buổi trò chuyện này.[12] Nếu không tính các chương trình thể thao, cuộc phỏng vấn giữa Winfrey và Jackson là chương trình có lượng khán giả lớn thứ tư trong lịch sử truyền hình Mỹ. Nó cũng châm ngòi cho hàng loạt buổi thuyết trình về chứng bạch biến – một căn bệnh mà rất ít người biết trước thời điểm mà cuộc phỏng vấn diễn ra.[8][13][14][15]

Jackson đã công khai tuyên bố rằng ông tự hào khi là người da đen.[16] Nam ca sĩ còn viết một bức thư cho nhiếp ảnh gia William Pecchi Jr. vào năm 1988 rằng: "Có lẽ tôi đã nhìn thế giới của chúng ta với lăng kính màu hồng nhưng tôi yêu tất cả mọi người trên hành tinh này. Đó là lý do tại sao những câu chuyện phân biệt chủng tộc thực sự làm phiền tôi. […] Bởi vì thực ra tôi tin rằng TẤT CẢ con người đều có quyền lợi như nhau, tôi đã được dạy về điều đó và sẽ luôn tin điều đó. Tôi chỉ không thể hiểu tại sao mọi người lại có thể nảy sinh mâu thuẫn chỉ vì màu da cơ thể. Tôi yêu tất cả các chủng tộc trên Trái Đất. Kì thi là biểu hiện của sự dốt nát. Chúng ta đến với thế giới này trong tình trạng không mảnh vải che thân và điều đó nhắc nhở tôi rằng tôi cũng như vậy sau lớp trang phục này, dù cho màu da sắc tộc có như thế nào đi chăng nữa."[17]

Taraborrelli tiết lộ rằng Jackson còn được chẩn đoán mắc bệnh lupus, cùng với bệnh bạch biến khiến ông rất nhạy cảm với ánh sáng mặt trời vì việc đó có thể làm cho bệnh của anh trở nên trầm trọng hơn.[1] Khám nghiệm tử thi của Michael Jackson không xác nhận cũng không bác bỏ về bệnh lupus, nhưng khẳng định tình trạng bạch biến của ông là có thật.[18][19] Làn da của ông được tìm thấy là có sự suy giảm (mặc dù không phải hoàn toàn) sắc tố melanin, các tế bào quyết định màu da con người.[20]

Để ngăn chặn quá trình lão hóa và mất màu ở da, Jackson đã sử dụng Solaquin, Tretinoin, và Benoquin.[1] Vào ngày 29 tháng 6 năm 2009, nhiều ống Benoquin và hydroquinone được tìm thấy tại nhà của Jackson. Ông cũng phải thường xuyên tiêm trực tiếp hydroxychloroquin vào da đầu để bảo vệ thận trước những tổn thương mà lao da có thể gây nên.[1] Những loại thuốc mà Jackson sử dụng và thói quen sử dụng phấn trang điểm khiến màu da của ông ngày càng sáng hơn.[1] Nam ca sĩ cũng bao phủ vùng da bị rối loạn của mình với quần áo dài tay và quần dài. Trong video ca nhạc của bài hát "Remember the Time", tất cả các vũ công và diễn viên ngoại trừ Jackson đều ăn mặc hở lưng như người Ai Cập cổ đại.[21] Jackson thường không mặc quần áo hoa văn để tránh sự chú ý đến vùng da rối loạn.[22]

Bệnh bạch biến xảy ra theo 3 kiểu khác nhau: Mất sắc tố ở một phần cơ thể, mất sắc tố tổng quát có nghĩa là nhiều bộ phận của cơ thể bị ảnh hưởng.[23] Báo cáo khám nghiệm tử thi của Michael Jackson tuyên bố rằng ông "mất sắc tố trọng tâm của làn da"[24](nghĩa là, mất sắc tố xảy ra trên một hoặc một vài vùng của cơ thể).[23] trong trường hợp của Jackson, đã có 5 khu vực bị ảnh hưởng.[24]

Năm 1996, trong lượt đầu tiên của HIStory World Tour, Jackson kết hôn với y tá da liễu của mình, Debbie Rowe.[25][26] Họ gặp nhau lần đầu vào giữa những năm 1980, khi Jackson được chẩn đoán mắc bệnh bạch biến. Cô đã đồng hành trong quá trình điều trị bệnh tật cho ông trong nhiều năm, cũng như động viên tinh thần, và họ xây dựng một tình bạn mạnh mẽ trước khi tiến tới hôn nhân.[27] Cặp vợ chồng ly dị vào năm 1999 và vẫn là bạn sau đó.[28]